Responsável: Elida Paula Benquique Ojopi (Projeto de pós-doutorado)
Supervisão: Emmanuel Dias Neto
Apoio: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
O objetivo deste projeto foi re-analisar a região cromossômica 22q11.2, que parece conter genes importantes para a progressão de tumores de laringe. Esta reanálise utilizou os dados gerados pelo Projeto Genoma Humano do Câncer, dados de ESTs gerados por outros grupos, diversos programas de predição, além de utilizar o genoma de Mus musculus, afim de identificar o conjunto de genes desta região, incluindo os possivelmente envolvidos no desenvolvimento ou progressão de carcinomas de laringe. Neste projeto, identificamos 12 regiões possivelmente codificadoras, das quais 3 foram confirmadas como expressas em laringe através de RT-PCR.
O fato de termos encontrado, ainda, possíveis novas regiões codificadoras, no cromossomo 22 (o primeiro cromossomo humano a ser seqüenciado), mostra que a identificação de todos os genes humanos não pode contar apenas com programas de predição ou dados de seqüências expressas em análises em larga escala. A anotação definitiva do genoma humano vai requerer ainda análises detalhadas seguidas de validação experimental.
Durante a execução deste projeto, vislumbramos a adequação desta abordagem para um objetivo ainda maior, a determinação do transcriptoma de tumores de cabeça e pescoço. Esta extensão ocorreu no âmbito do projeto hoje conhecido como "Head & Neck Transcriptome Initiative" (HNTI), que envolve cerca de 60 pesquisadores do Estado de São Paulo. O início do HNTI ampliou os horizontes deste projeto na medida em que incorporamos tecidos ainda não estudados (tais como hipofaringe, cavidade oral e tireóide) e partimos para uma análise dos transcritos em todo o genoma humano, não mais nos limitando a um determinado bloco do cromossomo 22.
